FBM Doctoral School Courses

FAIR Research Data Management in biomedical and clinical research

ED 26/Série 4 (link)

Faculté de gestion: Ecole doctorale (FBM-DOCT)

Teachers: C. Lebrand, J. Dénéréaz
Language: 
English
Credits: 0.25

Responsable: Cécile Lebrand, PhD

Details

Fiche de cours

FAIR Research Data Management in biomedical and clinical research – ED 26/Série 4

Faculté de gestion: Ecole doctorale (FBM-DOCT)

Responsable(s): Cécile Lebrand
Période de validité: 2023 ->

Pas d’horaire défini.

Cours

Annuel

Langue(s) d’enseignement: anglais
Public: Oui
Crédits: 0.25

Objectif

At the end of the course participant should be able to put in place a DMP and to share their published data in Open Access, making possible to:
-respond to the requirements of the journals and financing agencies which require shared standards for open practices in research
-anticipate in detail the management of research data, specifying how this data is going to be analysed, organised, stored, secured and shared.
-how to use the online DMP Canvas Generator tool

Contenu

During the first part of this workshop, participants will be taught best practices in data management and how to collect, describe, store, secure and archive research data. they will be introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation.The second half of the workshop will be dedicated to practical on Data management, where participants will learn how to fill a DMP corresponding to their research project and how to share their published data on adapted repository.

Evaluation

Travail personnel : Non
Présentation : Non
Test final : Non
Evaluation de la participation par l’enseignant : Oui

Bibliographie

– Begley, C G, and Ioannidis, J. PA. “Reproducibility in science improving the standard for basic and preclinical research.” Circulation research. 2015; 116.1: 116-126. – Chalmers I, Glasziou P. Avoidable Waste in the Production and Reporting of Research Evidence. Lancet. 2009; 374(9683): 86-89. – Freedman LP, Cockburn IM, Simcoe TS. The Economics of Reproducibility in Preclinical Research. PLoS Biol. 2015;13(6): e1002165. – Howells, D. W., Sena E.S., and Macleod, M.R. Bringing rigour to translational medicine. Nat Rev Neurol. 2014 Jan;10(1):37-43. https://www.vital-it.ch/research/software/DMPCanvasGenerator https://mantra.edina.ac.uk/ https://zenodo.org/

Exigences du cursus d’études

!!! You should come to the course with a detailed list of the research data you will acquire and analyze during your thesis work, the formats associated with your data, and the equipment and software used !!!

Knowledge / competencies
To be involve in Life Sciences research
Technical
Please bring your personal laptop as we will use it for the practical part of the course

Conditions d’octroi

Participation active attestée par le responsable.

Conditions d’accès

Inscription auprès de l’Ecole doctorale. Série 3

UtilisationCode facultéStatutCrédits
Doctorat en médecine et ès sciences (MD-PhD) (2010 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel
Doctorat ès sciences de la vie (2003 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel
Doctorat ès sciences de la vie – Ecology and Evolution (2007 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel
Doctorat ès sciences de la vie – programme Cancer and Immunology (2008 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel
Doctorat ès sciences de la vie – programme Cardiovasculaire et métabolisme (2005 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel
Doctorat ès sciences de la vie – programme Integrated Experimental and Computational Biology (2010 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel
Doctorat ès sciences de la vie – programme Microbial Sciences (2010 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel
Doctorat ès sciences de la vie – programme Quantitative Biology (2018 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel

Science Integrity in biomedical sciences : an open science approach

ED 29/Série 3 (link)

Faculté de gestion: Ecole doctorale (FBM-DOCT)

Responsable: Sandrine Pernier and Cécile Lebrand, PhD
Language: 
English
Credits: 1

Details

Fiche de cours

Science Integrity in biomedical sciences : an open science approach/Intégrité scientifique en science biomédicale : une approche par le prisme de la science ouverte – ED 29/Série 3

Faculté de gestion: Ecole doctorale (FBM-DOCT)

Responsable(s): Cécile Lebrand, Sandrine Pernier
Période de validité: 2023 ->

Pas d’horaire défini.

Cours

Annuel

Langue(s) d’enseignement: anglais
Public: Oui
Crédits: 1

Objectif

En suivant le cycle de vie de la recherche, cette formation pratique permet, par le prisme de l’Open Science, de prendre connaissance des éléments contribuants au développement d’une science intègre et transparente. Un focus particulier est donné sur les directives et ressources propres à la Faculté de Biologie et Médecine à l’UNIL et CHUV mais les principes sont transposables à d’autres facultés dans les mêmes discipline.

Contenu

5 modules avec différents intervenants:

1. Intégrité scientifique : définition et principes. Contexte de la Faculté de Biologie et Médecine à l’UNIL et CHUV.
2. Cycle de la recherche : rigueur et transparence
3. Diffusion des résultats, processus de publication
4. Valoriser son travail: devoirs et responsabilités
5. Discussion – Clôture du cours

Evaluation

Travail personnel de préparation : Oui
Présentation personnelle : Oui
Test final : Non
Evaluation de la participation par le tuteur : Oui

Formation en 3 temps :

Jour 1: journée complète en présentiel
Jour 2: demie journée de travail en autonomie
Jour 3: demie journée en présentiel

Bibliographie

Will be done with the set of documents before de course

Exigences du cursus d’études

Aucun

Conditions d’accès

Inscription auprès de l’Ecole doctorale. Série 3.

UtilisationCode facultéStatutCrédits
Doctorat en médecine et ès sciences (MD-PhD) (2010 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel1.00
Doctorat ès sciences de la vie (2003 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel1.00
Doctorat ès sciences de la vie – Ecology and Evolution (2007 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel1.00
Doctorat ès sciences de la vie – programme Cancer and Immunology (2008 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel1.00
Doctorat ès sciences de la vie – programme Cardiovasculaire et métabolisme (2005 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel1.00
Doctorat ès sciences de la vie – programme Integrated Experimental and Computational Biology (2010 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel1.00
Doctorat ès sciences de la vie – programme Microbial Sciences (2010 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel1.00
Doctorat ès sciences de la vie – programme Quantitative Biology (2018 ->) ›› Cours de 3e cycle de l’Ecole doctoraleED-FBMOptionnel1.00

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