La Collaboration UNIL + Cinémathèque suisse est organisée par un Comité de pilotage qui se compose de représentants de la Cinémathèque suisse et de la Section d’histoire et esthétique du cinéma : Frédéric Maire et Chicca Bergonzi pour la Cinémathèque, François Albera et Maria Tortajada pour l’UNIL. La fonction du Comité de pilotage est de discuter et de décider des projets à développer, ainsi que de favoriser le partenariat avec des institutions diverses dans la réalisation de projets concrets. Au printemps 2011, deux chercheurs – Pierre-Emmanuel Jaques et Alessia Bottani – ont été engagés par l’UNIL pour le compte de la Section d’histoire et esthétique du cinéma, dans le cadre de la Collaboration UNIL + Cinémathèque suisse. En juin 2013, ils ont été rejoints par un troisième chercheur engagé par l’UNIL, Stéphane Tralongo. Ces trois chercheurs travaillent sous la direction du Comité de pilotage et, le cas échéant, du directeur de telle ou telle recherche spécifique lancée dans le cadre de la Collaboration. Les doctorants engagés dans les projets lancés par la Collaboration et financés par le FNS sont impliqués dans la Collaboration UNIL + Cinémathèque suisse, qui a permis le financement de leur recherche.