{"id":4100,"date":"2021-11-30T16:01:09","date_gmt":"2021-11-30T15:01:09","guid":{"rendered":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/?p=4100"},"modified":"2024-04-15T15:20:49","modified_gmt":"2024-04-15T13:20:49","slug":"on-shybride-ou-on-fait-genome-a-part","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/on-shybride-ou-on-fait-genome-a-part\/","title":{"rendered":"On s\u2019hybride ou on fait g\u00e9nome \u00e0 part ?"},"content":{"rendered":"\n<p><strong>Comment, et sur combien de temps, se s\u00e9pare-t-on de ses cong\u00e9n\u00e8res pour devenir une autre esp\u00e8ce, incompatible g\u00e9n\u00e9tiquement\u00a0? Les r\u00e9ponses de Christophe Dufresnes et Nicolas Perrin, \u00e0 partir du cas des amphibiens europ\u00e9ens. Une \u00e9tude publi\u00e9e dans la revue <em>PNAS.<\/em><\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>La formation de nouvelles esp\u00e8ces peut a priori suivre des chemins tr\u00e8s diff\u00e9rents. D\u2019un c\u00f4t\u00e9, une mutation majeure sur un ou quelques g\u00e8nes essentiels peut suffire \u00e0 s\u00e9parer deux lign\u00e9es, les emp\u00eachant de se reproduire ensemble. Ancien doctorant au D\u00e9partement d\u2019\u00e9cologie et \u00e9volution de l\u2019UNIL, aujourd\u2019hui professeur \u00e0 l\u2019Universit\u00e9 NJFU de Nanjing, Christophe Dufresnes cite par exemple deux esp\u00e8ces d\u2019escargots devenues physiquement incapables de s\u2019accoupler en raison d\u2019une mutation qui inverse le sens d\u2019enroulement de leur coquille. Nicolas Perrin, professeur honoraire de l\u2019UNIL, \u00e9voque aussi le cas d\u2019esp\u00e8ces \u00ab&nbsp;cryptiques&nbsp;\u00bb parfaitement similaires aux yeux des humains \u2013 par exemple certains crustac\u00e9s de bord de mer \u2013 et qui pourtant se reconnaissent entre elles en raison du simple changement d\u2019un compos\u00e9 chimique, qui emp\u00eache d\u2019embl\u00e9e toute attirance sexuelle. Ces mutations peuvent se produire \u00ab&nbsp;hypervite&nbsp;\u00bb, affirme Nicolas Perrin, soit quelques dizaines de g\u00e9n\u00e9rations pour se fixer dans une population.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img alt=\"\" loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"1024\" height=\"597\" src=\"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2021\/11\/christophe_dufrenes-nicolas_perrin-2595-2-1024x597.jpg\" alt=\"\" class=\"wp-image-4110\" srcset=\"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2021\/11\/christophe_dufrenes-nicolas_perrin-2595-2-1024x597.jpg 1024w, https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2021\/11\/christophe_dufrenes-nicolas_perrin-2595-2-300x175.jpg 300w, https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2021\/11\/christophe_dufrenes-nicolas_perrin-2595-2-768x448.jpg 768w, https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2021\/11\/christophe_dufrenes-nicolas_perrin-2595-2-540x315.jpg 540w, https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2021\/11\/christophe_dufrenes-nicolas_perrin-2595-2-1080x630.jpg 1080w, https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2021\/11\/christophe_dufrenes-nicolas_perrin-2595-2.jpg 1200w\" sizes=\"auto, (max-width: 1024px) 100vw, 1024px\" \/><figcaption>Les biologistes Christophe Dufresnes et Nicolas Perrin percent l\u2019un des myst\u00e8res de la sp\u00e9ciation ou formation des esp\u00e8ces. \u00a9 F\u00e9lix Imhof \/ UNIL<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n<p>Publi\u00e9e dans la revue scientifique <em>PNAS (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America),<\/em> l\u2019\u00e9tude men\u00e9e par Christophe Dufresnes et 13 collaborateurs europ\u00e9ens, dont plusieurs membres de l\u2019UNIL, met en \u00e9vidence une dynamique tr\u00e8s diff\u00e9rente pour aboutir \u00e0 l\u2019incompatibilit\u00e9 reproductive. \u00ab\u00a0Cela s\u2019apparente \u00e0 plusieurs petites pannes sur toute une s\u00e9rie de g\u00e8nes r\u00e9partis sur l\u2019ensemble du g\u00e9nome, et non pas \u00e0 une grosse panne dans une seule r\u00e9gion\u00a0\u00bb, d\u00e9crivent les scientifiques. Ces petites incompatibilit\u00e9s s\u2019accumulent progressivement, sur des millions d\u2019ann\u00e9es. Au d\u00e9but la reproduction reste possible, mais la survie ou la f\u00e9condit\u00e9 des hybrides s\u2019\u00e9tiole au fil de l\u2019\u00e9volution. En effet, les deux esp\u00e8ces \u00e9changent encore du mat\u00e9riel g\u00e9n\u00e9tique, mais les mutations diff\u00e9rentes accumul\u00e9es sur les g\u00e8nes n\u2019ayant pas \u00e9volu\u00e9 ensemble les emp\u00eachent de bien fonctionner entre eux.<\/p>\n\n\n\n<h5 class=\"wp-block-heading\">L\u2019introgression ou la s\u00e9paration<\/h5>\n\n\n\n<p>L\u2019\u00e9tude, focalis\u00e9e sur les amphibiens europ\u00e9ens (crapauds, grenouilles, rainettes), a port\u00e9 sur plus de 40 zones g\u00e9ographiques de contact entre lign\u00e9es ayant diverg\u00e9 depuis moins d\u2019un million jusqu\u2019\u00e0 20 millions d\u2019ann\u00e9es. Les auteurs ont s\u00e9quenc\u00e9 l\u2019ADN des individus hybrides dans ces zones de contact, pour identifier les \u00e9ventuelles incompatibilit\u00e9s g\u00e9n\u00e9tiques entre les deux esp\u00e8ces dont ils sont issus. Lorsque les lign\u00e9es de batraciens ont diverg\u00e9 r\u00e9cemment, leurs g\u00e8nes se m\u00e9langent encore sur de longues distances de part et d\u2019autre de la zone de contact (on peut ainsi retrouver des g\u00e8nes \u00ab&nbsp;\u00e9trangers&nbsp;\u00bb 200 kilom\u00e8tres plus loin)&nbsp;: on parle alors d\u2019introgression massive, et cela montre que les g\u00e9nomes restent compatibles. Mais si le temps de divergence exc\u00e8de cinq \u00e0 six millions d\u2019ann\u00e9es, les g\u00e8nes ne se m\u00e9langent plus que sur quelques petits kilom\u00e8tres. Le processus de sp\u00e9ciation (la formation d\u2019esp\u00e8ce) est alors achev\u00e9. Sur le site de Romans-sur-Is\u00e8re (France), par exemple, au point de rencontre de deux esp\u00e8ces de crapauds du sud et du nord de l\u2019Europe ayant diverg\u00e9 il y a 5,2 millions d\u2019ann\u00e9es, la distance d\u2019introgression des g\u00e8nes ne d\u00e9passe pas 10 kilom\u00e8tres en moyenne.<\/p>\n\n\n\n<p>En conclusion on peut dire que l\u2019incompatibilit\u00e9 reproductive, qui signale le saut entre les esp\u00e8ces, est, chez les amphibiens, le r\u00e9sultat de nombreuses petites mutations g\u00e9n\u00e9tiques, n\u00e9cessitant beaucoup de temps pour s\u2019accumuler sur l\u2019ensemble du g\u00e9nome&nbsp;: il a fallu entre trois et cinq millions d\u2019ann\u00e9es d\u2019isolement pour rendre incompatibles les amphibiens \u00e9tudi\u00e9s ici \u00e0 travers leurs malheureux hybrides. Cette \u00e9tude d\u00e9montre la nature tr\u00e8s graduelle de la sp\u00e9ciation et permet de mieux classer les lign\u00e9es \u00e9volutives en esp\u00e8ces ou sous-esp\u00e8ces, ce qui est central en taxonomie.<\/p>\n\n\n\n<p><a href=\"https:\/\/www.pnas.org\/content\/118\/36\/e2103963118\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">L\u2019\u00e9tude dans <em>PNAS<\/em><\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>pour devenir une autre esp\u00e8ce, incompatible g\u00e9n\u00e9tiquement\u00a0? 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