{"id":1808,"date":"2021-04-22T09:32:00","date_gmt":"2021-04-22T07:32:00","guid":{"rendered":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/?p=1808"},"modified":"2024-04-15T15:22:40","modified_gmt":"2024-04-15T13:22:40","slug":"un-doctorant-mordu-de-rivieres","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/un-doctorant-mordu-de-rivieres\/","title":{"rendered":"Un doctorant mordu de rivi\u00e8res"},"content":{"rendered":"\n

Matteo Roncoroni, de la Facult\u00e9 des g\u00e9osciences et de l\u2019environnement \u00e0 l\u2019UNIL, effectue une th\u00e8se sur les biofilms dans les cours d\u2019eau glaciaires et pratique avec passion la p\u00eache \u00e0 la mouche. Portrait.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

En traversant un ruisseau pieds nus ou en marchant sur une plage de galets, vous avez peut-\u00eatre d\u00e9j\u00e0 gliss\u00e9 \u00e0 cause de la substance brun-vert un peu gluante que l\u2019on trouve sur la surface des cailloux. C\u2019est pr\u00e9cis\u00e9ment cette mati\u00e8re-l\u00e0, les biofilms, une matrice adh\u00e9sive s\u00e9cr\u00e9t\u00e9e par une communaut\u00e9 multicellulaire complexe (bact\u00e9ries, algues, champignons ou protozoaires), que Matteo Roncoroni \u00e9tudie dans le cadre de sa th\u00e8se entam\u00e9e en 2018 \u00e0 l\u2019Institut des dynamiques de la surface terrestre.<\/p>\n\n\n\n

Pand\u00e9mie oblige, ce n\u2019est pas au bord de la Sorge que nous faisons la connaissance de ce sympathique doctorant, mais par \u00e9crans interpos\u00e9s, chacun chez soi (il vit \u00e0 un jet de pierre du campus de Dorigny). Son compte Instagram (@swissflyfisherman<\/a>), g\u00e9r\u00e9 d\u2019une main de ma\u00eetre, nous aide aussi \u00e0 nous faire une id\u00e9e de ce scientifique qui semble passer ses journ\u00e9es les pieds dans l\u2019eau des ruisseaux de montagne, autant pour son travail que pour son hobby principal, la p\u00eache.  <\/p>\n\n\n\n

Tr\u00e8s bon vulgarisateur, aux explications br\u00e8ves et efficaces teint\u00e9es d\u2019un petit accent tessinois \u2013 il est originaire de la r\u00e9gion verdoyante du Mendrisiotto \u2013 il s\u2019excuse de parfois chercher ses mots, lui qui a plut\u00f4t l\u2019habitude d\u2019utiliser l\u2019anglais pour \u00e9voquer ses recherches. Pourtant tout est limpide. \u00ab Je travaille sur les biofilms pr\u00e9sents dans les environnements glaciaires, en haute montagne \u00bb, pr\u00e9cise-t-il. Pour cela, il effectue son travail de terrain pendant la p\u00e9riode estivale aux abords du glacier d\u2019Otemma, au fin fond du val de Bagnes en Valais, \u00e0 l\u2019instar de la majorit\u00e9 des chercheurs qui, comme lui, sont rattach\u00e9s au groupe AlpWISE (Alpine Water, Ice, Sediment and Ecology), dirig\u00e9 par le professeur \u00e0 l\u2019UNIL Stuart Lane. AlpWISE cherche \u00e0 \u00e9tudier les impacts du changement climatique rapide et des activit\u00e9s humaines sur toutes les composantes des paysages alpins. Le groupe de chercheurs \u00e9tablit un camp de base estival tous les \u00e9t\u00e9s, depuis 2017. En 2020, cela avait \u00e9t\u00e9 le cas de la mi-juin \u00e0 la mi-septembre. Le couvert sera remis d\u00e8s le mois de mai 2021.<\/p>\n\n\n\n

\"Matteo
En gros plan, une pierre recouverte de biofilm, tenue par Matteo Roncoroni. \u00a9 Davide Mancini, \u00e9galement doctorant \u00e0 la Facult\u00e9 des g\u00e9osciences et de l\u2019environnement.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n
Les biofilms, petits ing\u00e9nieurs de l\u2019\u00e9cosyst\u00e8me ?<\/strong><\/h5>\n\n\n\n

Le Tessinois cherche \u00e0 comprendre comment l\u2019environnement de la vall\u00e9e glaciaire d\u2019Otemma, surtout la plaine alluviale situ\u00e9e en aval du glacier, d\u00e9termine o\u00f9 les biofilms (dont on peut dire qu\u2019ils forment la base de la cha\u00eene alimentaire du cours d\u2019eau) peuvent prosp\u00e9rer. Il a formul\u00e9 diff\u00e9rentes hypoth\u00e8ses. Tout d\u2019abord, \u00ab on observe qu\u2019aux endroits o\u00f9 le cours d\u2019eau sort directement du glacier, avec un fort d\u00e9bit et bien charg\u00e9 en s\u00e9diments, on ne trouve pas de biofilms, sauf lorsque la puissance de l\u2019eau est r\u00e9duite en automne ou juste avant la fonte des neiges. On voit aussi qu\u2019ils s\u2019installent bien dans les zones o\u00f9 l\u2019eau s\u2019\u00e9coule par les versants, car cette derni\u00e8re ne les \u00e9rode pas continuellement. Et l\u00e0 on remarque que la v\u00e9g\u00e9tation se d\u00e9veloppe \u00e0 c\u00f4t\u00e9 des chenaux. \u00bb Selon Matteo Roncoroni et ses coll\u00e8gues, les biofilms cr\u00e9eraient une couche imperm\u00e9able permettant \u00e0 la v\u00e9g\u00e9tation de s\u2019installer. <\/p>\n\n\n\n

En d\u00e9coule une autre hypoth\u00e8se : les biofilms fertiliseraient les s\u00e9diments d\u00e9pos\u00e9s par le recul glaciaire (\u00e0 la base tr\u00e8s pauvres en nutriments), ce qui permettrait \u00e0 de petites plantes et \u00e0 d\u2019autres organismes de vivre. \u00ab Nous pr\u00e9sumons que les biofilms agissent comme des ing\u00e9nieurs de l\u2019\u00e9cosyst\u00e8me, capables de tourner une condition naturelle \u00e0 leur avantage, mais aussi d\u2019en faire b\u00e9n\u00e9ficier d\u2019autres esp\u00e8ces vivantes \u00bb, avance l\u2019universitaire de 29 ans.<\/p>\n\n\n\n

Des drones au service de la science<\/strong><\/h5>\n\n\n\n

L\u00e0-haut \u00e0 Otemma, celui qui a effectu\u00e9 un Bachelor suivi d\u2019un Master en g\u00e9ographie physique \u00e0 l\u2019UNIL utilise des drones comme outil de travail. Ces derniers lui permettent de mod\u00e9liser la morphologie du terrain et de cartographier l\u2019\u00e9volution des biofilms immortalis\u00e9e pendant l\u2019\u00e9t\u00e9 2020, l\u2019id\u00e9e \u00e9tant de cr\u00e9er une s\u00e9rie temporelle sur leur d\u00e9veloppement, indique Matteo Roncoroni, d\u00e9j\u00e0 familier de ces petits a\u00e9ronefs : pour son travail de master (\u00e9galement dirig\u00e9 par Stuart Lane), il les avait utilis\u00e9s pour \u00e9laborer un syst\u00e8me permettant de cartographier les fray\u00e8res, zones de reproduction des salmonid\u00e9s.<\/p>\n\n\n\n

\"Drone
Drone en pleine action \u00e0 Otemma. \u00a9 Matteo Roncoroni<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Le Lausannois d\u2019adoption, dont la t\u00e2che hivernale est notamment d\u2019\u00e9laborer ces cartes \u00e0 l\u2019ordinateur, se r\u00e9jouit de mener une autre exp\u00e9rience durant la belle saison 2021 \u00e0 Otemma : il fera s\u2019\u00e9couler de l\u2019eau sur des s\u00e9diments plac\u00e9s au fond de canaux en PVC (6 m\u00e8tres de long et 30 centim\u00e8tres de large) et y laissera les biofilms se d\u00e9velopper. \u00ab On pourra mesurer par exemple \u00e0 quelle vitesse l\u2019eau devient destructrice pour les biofilms, ou encore d\u00e9terminer l\u2019impact de ces derniers sur le ph\u00e9nom\u00e8ne d\u2019infiltration d\u2019eau dans les s\u00e9diments. Ce sera plus difficile de faire cela en pleine nature plut\u00f4t qu\u2019en laboratoire, o\u00f9 toutes les conditions sont contr\u00f4l\u00e9es \u00bb, explique le chercheur.   <\/p>\n\n\n\n

Matteo Roncoroni terminera sa th\u00e8se en 2022. Les recherches qu\u2019il aura men\u00e9es devraient servir \u00e0 bousculer le paradigme en place qui affirme que pendant l\u2019\u00e9t\u00e9, en haute montagne, les biofilms et les macro-invert\u00e9br\u00e9s qui s\u2019en nourrissent ne s\u2019installent pas dans ces zones car les cours d\u2019eau glaciaires sont trop puissants et charrient trop de s\u00e9diments. \u00ab Si nous r\u00e9ussissons \u00e0 d\u00e9montrer que m\u00eame \u00e0 la belle saison il existe des zones assez stables permettant au biofilm de se d\u00e9velopper, ce serait une nouvelle d\u00e9couverte, oui, affirme le scientifique au pied montagnard. Si cette hypoth\u00e8se se confirme, on pourrait avancer que les biofilms ont tenu un r\u00f4le important, par exemple apr\u00e8s les grandes glaciations du pass\u00e9. Quand les glaciers ont fondu peu \u00e0 peu, ce sont peut-\u00eatre ces matrices qui ont aid\u00e9 la v\u00e9g\u00e9tation \u00e0 r\u00e9investir ces zones inhospitali\u00e8res. \u00bb<\/p>\n\n\n\n