{"id":11785,"date":"2024-12-16T11:08:59","date_gmt":"2024-12-16T10:08:59","guid":{"rendered":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/?p=11785"},"modified":"2025-02-24T11:08:53","modified_gmt":"2025-02-24T10:08:53","slug":"geneticien-par-passion","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/geneticien-par-passion\/","title":{"rendered":"G\u00e9n\u00e9ticien par passion"},"content":{"rendered":"\n

Professeur \u00e0 la Facult\u00e9 de biologie et de m\u00e9decine et chef du Service de m\u00e9decine g\u00e9n\u00e9tique du CHUV depuis le 15 janvier 2024, C\u00e9dric Le Caignec nous plonge dans le secret des g\u00e8nes.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Il faut entrer sur la pointe des pieds dans l\u2019univers de la g\u00e9n\u00e9tique quand on ne poss\u00e8de pas les bases n\u00e9cessaires pour s\u2019y aventurer. Car le domaine, pourtant enseign\u00e9 par le professeur Le Caignec en premi\u00e8re ann\u00e9e de m\u00e9decine \u00e0 l\u2019UNIL, ne se donne pas facilement \u00e0 comprendre. Lors de sa r\u00e9cente le\u00e7on inaugurale au CHUV, sur le th\u00e8me \u00ab la g\u00e9n\u00e9tique de l\u2019autisme pour les non-g\u00e9n\u00e9ticiens \u00bb, il a abord\u00e9 d\u2019une mani\u00e8re vive la question de cette maladie aux ph\u00e9notypes vari\u00e9s : le trouble du spectre autistique (TSA) peut \u00eatre isol\u00e9 ou associ\u00e9 \u00e0 d\u2019autres signes, dont la d\u00e9ficience intellectuelle, pour certains, ou le TSA de type Asperger, pour d\u2019autres. Le ph\u00e9notype est variable en fonction notamment des g\u00e8nes mut\u00e9s, mais aussi du type et de la quantit\u00e9 des variations sur plusieurs g\u00e8nes.<\/p>\n\n\n\n

En France, le professeur Le Caignec (qui aime se d\u00e9finir comme breton) a beaucoup travaill\u00e9 \u2013 et continue au CHUV \u2013 sur les maladies g\u00e9n\u00e9tiques rares (par exemple la mucoviscidose, o\u00f9 le fait de porter un g\u00e8ne CFTR mut\u00e9 transmis par la m\u00e8re et l\u2019autre par le p\u00e8re, et non un seul g\u00e8ne mut\u00e9, provoque la maladie), l\u2019oncog\u00e9n\u00e9tique (les pr\u00e9dispositions au cancer) ou encore le diagnostic pr\u00e9natal ou pr\u00e9implantatoire. Dans cet article nous abordons l\u2019autisme et, dans une moindre mesure, la schizophr\u00e9nie, deux maladies qui touchent au fonctionnement synaptique, avec un diagnostic diff\u00e9rent mais quelques traits en commun, et toutes deux influenc\u00e9es dans leur \u00e9volution par l\u2019environnement.<\/p>\n\n\n\n

Ne pas r\u00e9duire la personne \u00e0 son diagnostic<\/h5>\n\n\n\n

\u00ab On ne peut pas aborder l\u2019autisme ou la schizophr\u00e9nie uniquement sous l\u2019angle de la pathologie ; m\u00eame s\u2019il y a toujours des souffrances, la pr\u00e9sentation clinique est tr\u00e8s variable, parfois ou par moments ce sont juste des particularit\u00e9s pas forc\u00e9ment pathologiques, si bien qu\u2019il ne faut pas r\u00e9duire la personne \u00e0 son diagnostic \u00bb, esquisse le professeur. Les patients concern\u00e9s par un trouble du spectre autistique (TSA) pr\u00e9sentent tous, peu ou prou, des \u00ab difficult\u00e9s d\u2019interactions sociales et des int\u00e9r\u00eats restreints que certains vont explorer de mani\u00e8re tr\u00e8s approfondie \u00bb. \u00c0 titre d\u2019exemple fameux d\u2019un autisme Asperger revendiqu\u00e9, C\u00e9dric Le Caignec cite Elon Musk…<\/p>\n\n\n\n

La part g\u00e9n\u00e9tique du TSA est estim\u00e9e \u00e0 80%\u00a0: il s\u2019agit de \u00abl\u2019h\u00e9ritabilit\u00e9\u00bb, qui n\u2019est pas n\u00e9cessairement h\u00e9rit\u00e9e, ou pas d\u2019une mani\u00e8re directe via un parent ou des membres identifi\u00e9s dans la famille\u00a0; ce pourcentage g\u00e9n\u00e9tique est comparable pour la schizophr\u00e9nie. Dans d\u2019autres cas (20%) la maladie est d\u00e9clench\u00e9e par des facteurs environnementaux (par exemple, au cours de la grossesse, des m\u00e9dicaments ou certaines infections virales). Le r\u00f4le du microbiote de l’enfant est une hypoth\u00e8se actuellement tr\u00e8s discut\u00e9e.<\/p>\n\n\n\n

Diff\u00e9rentes formes d\u2019h\u00e9ritabilit\u00e9<\/strong><\/h5>\n\n\n\n

Comment se d\u00e9cline l\u2019h\u00e9ritabilit\u00e9 ? Le professeur Le Caignec cite au moins deux situations diff\u00e9rentes : la premi\u00e8re (10 \u00e0 20% des patients) implique presque toujours un autisme (ou une schizophr\u00e9nie) avec d\u00e9ficience intellectuelle car la maladie d\u00e9rive alors d\u2019un g\u00e8ne tr\u00e8s important pour le bon fonctionnement c\u00e9r\u00e9bral ; une fois mut\u00e9s (ph\u00e9nom\u00e8ne fort heureusement rare), ces g\u00e8nes tels que les trois membres de la famille SHANK, tr\u00e8s impliqu\u00e9s dans le fonctionnement synaptique, entra\u00eenent une telle d\u00e9ficience.<\/p>\n\n\n\n

Plus d\u2019une centaine de g\u00e8nes diff\u00e9rents peuvent \u00eatre porteurs de ce type de variation g\u00e9n\u00e9tique et ont alors un effet tr\u00e8s fort sur le TSA. Les cent g\u00e8nes (et plus…) connus pour entra\u00eener un TSA en cas de mutations rares \u00e0 effet fort ne sont en outre pas uniquement associ\u00e9s au fonctionnement synaptique ; ils peuvent participer \u00e0 la structure de l\u2019ADN qui, subissant une alt\u00e9ration, va d\u00e9r\u00e9guler ces g\u00e8nes lors d\u2019un \u00ab remodelage chromatinien \u00bb et faire \u00e9merger la maladie…<\/p>\n\n\n\n

Petites variations sur plusieurs g\u00e8nes<\/strong><\/h5>\n\n\n\n

La deuxi\u00e8me situation d\u2019h\u00e9ritabilit\u00e9 concerne au contraire des variations fr\u00e9quentes dans la population g\u00e9n\u00e9rale (mais encore plus chez les patients TSA), quoique \u00e0 effet faible sur le d\u00e9clenchement de la maladie. \u00ab Chez la majorit\u00e9 des personnes avec TSA on ne trouve pas un g\u00e8ne tr\u00e8s fort qui explique la maladie, mais quantit\u00e9 de petites variations ; une seule ne suffisant pas \u00e0 d\u00e9clencher les sympt\u00f4mes, on parle de poids mutationnel quand on a une combinaison de dizaines de ces variations sur des g\u00e8nes diff\u00e9rents, car alors on passe un certain seuil qui fait \u00e9merger les particularit\u00e9s c\u00e9r\u00e9brales associ\u00e9es \u00e0 ces maladies. On peut donc \u00eatre porteur de certaines de ces variations g\u00e9n\u00e9tiques et ne pr\u00e9senter aucun signe clinique \u00bb, d\u00e9crit notre professeur. Le part de ces variations fr\u00e9quentes \u00e0 effet faible dans l\u2019h\u00e9ritabilit\u00e9 est encore difficile \u00e0 estimer. Actuellement, elle serait \u00e9valu\u00e9e \u00e0 moins de 10%.<\/p>\n\n\n\n

Pas une seule cause<\/strong><\/h5>\n\n\n\n

Ces variations g\u00e9n\u00e9tiques peuvent \u00eatre fr\u00e9quentes et pr\u00e9sentes dans la famille (mais sans effet fort sur le TSA) ou au contraire appara\u00eetre de novo<\/em> lors de la phase de r\u00e9plication de l\u2019ADN au cours de la formation des gam\u00e8tes (par exemple s\u2019agissant de l\u2019un des g\u00e8nes SHANK \u00e0 effet fort). Le plus souvent, les variations fr\u00e9quentes \u00e0 effet faible concernent des g\u00e8nes diff\u00e9rents de la centaine dont le dysfonctionnement rare engendre un effet fort ; cependant, comme le pr\u00e9cise notre sp\u00e9cialiste, \u00ab il peut s\u2019agir aussi de g\u00e8nes parmi cette centaine mais avec des mutations forc\u00e9ment diff\u00e9rentes, sans effet d\u00e9vastateur qui casse le g\u00e8ne et le rend inop\u00e9rant, plut\u00f4t donc une variation o\u00f9 la prot\u00e9ine pourra encore jouer son r\u00f4le quoique de mani\u00e8re un peu affaiblie, et cette petite d\u00e9r\u00e9gulation sur un g\u00e8ne va sans doute contribuer au TSA mais certainement pas en \u00eatre \u00e0 elle seule la cause \u00bb.<\/p>\n\n\n\n

Le myst\u00e8re demeure<\/strong><\/h5>\n\n\n\n

C\u00e9dric Le Caignec souligne que pour ces patients dont la maladie rel\u00e8ve de l\u2019h\u00e9ritabilit\u00e9 (par opposition \u00e0 l\u2019environnement) mais porteurs de variants fr\u00e9quents \u00e0 effet faible, une analyse g\u00e9n\u00e9tique ne va logiquement pas r\u00e9v\u00e9ler un \u00e9v\u00e9nement fort (h\u00e9r\u00e9ditaire ou de novo<\/em>) responsable de l\u2019apparition d\u2019un TSA souvent associ\u00e9 \u00e0 un autre sympt\u00f4me tel que la d\u00e9ficience intellectuelle. Pour ces patients, l\u2019analyse g\u00e9n\u00e9tique ne changera donc rien \u00e0 la connaissance de leur maladie ni \u00e0 leur prise en charge.<\/p>\n\n\n\n

Enfin, une troisi\u00e8me situation g\u00e9n\u00e9tique pourrait impliquer des variants rares, cette fois \u00e0 effet faible, mais on les conna\u00eet encore mal. Ils pourraient \u00e9clairer \u00ab the missing heritability,<\/em> soit la part g\u00e9n\u00e9tique de la maladie qui ne s\u2019explique ni par les variants rares \u00e0 effet fort, ni par les variants fr\u00e9quents \u00e0 effet faible \u00bb, pr\u00e9cise C\u00e9dric Le Caignec.<\/p>\n\n\n\n

Diagnostic g\u00e9n\u00e9tique pr\u00e9natal<\/strong><\/h5>\n\n\n\n

Un mot, pour terminer, sur le diagnostic g\u00e9n\u00e9tique pr\u00e9natal, demand\u00e9 lorsqu\u2019une \u00e9chographie r\u00e9v\u00e8le de mani\u00e8re assez pr\u00e9cise une anomalie pouvant faire suspecter une maladie g\u00e9n\u00e9tique, autrement dit, le plus souvent, apr\u00e8s le cinqui\u00e8me mois de grossesse. \u00ab Analyser 5000 g\u00e8nes pour une anomalie c\u00e9r\u00e9brale est un travail qui prend du temps, c\u00f4t\u00e9 technique et c\u00f4t\u00e9 interpr\u00e9tation \u00bb, souligne le professeur. Selon le probl\u00e8me suspect\u00e9, l\u2019analyse porte sur nettement moins de g\u00e8nes : \u00ab Si c\u2019est une malformation cardiaque, on va analyser quelques dizaines de g\u00e8nes seulement car, en l\u2019\u00e9tat, on conna\u00eet beaucoup plus de g\u00e8nes susceptibles d\u2019intervenir dans un dysfonctionnement c\u00e9r\u00e9bral que dans une anomalie cardiaque. Pour le pr\u00e9natal, nous avons un circuit en urgence mais on devrait pouvoir faire mieux avec plus de g\u00e9n\u00e9ticiens et plus de moyens \u00bb, consid\u00e8re le sp\u00e9cialiste.<\/p>\n\n\n\n

En effet, le temps presse et il devient tr\u00e8s d\u00e9licat de pr\u00e9coniser \u00e0 la patiente concern\u00e9e une interruption m\u00e9dicale de grossesse \u00e0 six ou sept mois. La g\u00e9n\u00e9tique m\u00e9dicale reste donc \u00e0 tout moment, et quelle que soit la maladie, un domaine proche des soins face \u00e0 des personnes bien r\u00e9elles, pas uniquement des pourcentages. Une r\u00e9alit\u00e9 que C\u00e9dric Le Caignec prend tr\u00e8s \u00e0 c\u0153ur.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

La g\u00e9n\u00e9tique n\u2019a pas perc\u00e9 tous les myst\u00e8res de l\u2019h\u00e9ritabilit\u00e9 li\u00e9s \u00e0 des maladies comme l\u2019autisme. Tour d\u2019horizon avec C\u00e9dric Le Caignec.<\/p>\n","protected":false},"author":1002082,"featured_media":11725,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_seopress_robots_primary_cat":"","_seopress_titles_title":"","_seopress_titles_desc":"","_seopress_robots_index":"","_uag_custom_page_level_css":"","footnotes":""},"categories":[100,9,109],"tags":[191,195],"class_list":{"0":"post-11785","1":"post","2":"type-post","3":"status-publish","4":"format-standard","5":"has-post-thumbnail","7":"category-biologie","8":"category-recherche","9":"category-sante","10":"tag-genetique","11":"tag-medecine"},"uagb_featured_image_src":{"full":["https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2024\/12\/cedric_le_gaignec-8824.jpg",1200,700,false],"thumbnail":["https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2024\/12\/cedric_le_gaignec-8824-150x150.jpg",150,150,true],"medium":["https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2024\/12\/cedric_le_gaignec-8824-300x175.jpg",300,175,true],"medium_large":["https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2024\/12\/cedric_le_gaignec-8824-768x448.jpg",580,338,true],"large":["https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2024\/12\/cedric_le_gaignec-8824-1024x597.jpg",580,338,true],"1536x1536":["https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2024\/12\/cedric_le_gaignec-8824.jpg",1200,700,false],"2048x2048":["https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2024\/12\/cedric_le_gaignec-8824.jpg",1200,700,false],"post-thumbnail":["https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2024\/12\/cedric_le_gaignec-8824.jpg",1200,700,false],"chaplin_preview_image_low_resolution":["https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2024\/12\/cedric_le_gaignec-8824-540x315.jpg",540,315,true],"chaplin_preview_image_high_resolution":["https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2024\/12\/cedric_le_gaignec-8824-1080x630.jpg",1080,630,true],"chaplin_fullscreen":["https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2024\/12\/cedric_le_gaignec-8824.jpg",1200,700,false],"gform-image-choice-sm":["https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2024\/12\/cedric_le_gaignec-8824-300x300.jpg",300,300,true],"gform-image-choice-md":["https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2024\/12\/cedric_le_gaignec-8824-400x400.jpg",400,400,true],"gform-image-choice-lg":["https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2024\/12\/cedric_le_gaignec-8824-600x600.jpg",600,600,true],"mailpoet_newsletter_max":["https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/files\/2024\/12\/cedric_le_gaignec-8824.jpg",1200,700,false]},"uagb_author_info":{"display_name":"Nadine Richon Salzmann","author_link":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/author\/nrichon\/"},"uagb_comment_info":0,"uagb_excerpt":"La g\u00e9n\u00e9tique n\u2019a pas perc\u00e9 tous les myst\u00e8res de l\u2019h\u00e9ritabilit\u00e9 li\u00e9s \u00e0 des maladies comme l\u2019autisme. Tour d\u2019horizon avec C\u00e9dric Le Caignec.","_links":{"self":[{"href":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11785","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1002082"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=11785"}],"version-history":[{"count":4,"href":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11785\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":11884,"href":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11785\/revisions\/11884"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/wp-json\/wp\/v2\/media\/11725"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=11785"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=11785"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/wp.unil.ch\/uniscope\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=11785"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}