{"id":11475,"date":"2025-08-26T15:34:44","date_gmt":"2025-08-26T13:34:44","guid":{"rendered":"https:\/\/wp.unil.ch\/svsn\/?page_id=11475"},"modified":"2025-08-28T14:20:03","modified_gmt":"2025-08-28T12:20:03","slug":"les-champignons-microscopiques-un-monde-meconnu","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/wp.unil.ch\/svsn\/les-champignons-microscopiques-un-monde-meconnu\/","title":{"rendered":"Les champignons microscopiques, un monde m\u00e9connu."},"content":{"rendered":"\n

Les maladies fongiques comme le mildiou, l\u2019o\u00efdium et la pourriture grise affectent diverses cultures, dont la vigne.\u00a0 La lutte contre ces maladies est complexe, mais les recherches men\u00e9es \u00e0 l\u2019Agroscope par Katia Gindro sur les champignons microscopiques permettent d\u2019envisager de nouvelles pistes pour prot\u00e9ger les cultures. Exploration de l\u2019univers des champignons microscopiques, un monde m\u00e9connu o\u00f9 des millions d\u2019esp\u00e8ces restent \u00e0 d\u00e9couvrir.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Une simple goutte de pluie peut contenir 10 \u00e0 15 esp\u00e8ces diff\u00e9rentes de champignons. En fait, les champignons microscopiques sont pr\u00e9sents partout. Avec d\u2019autres micro-organismes, ils nous entourent par millions, dans l\u2019air, dans les sols, dans l\u2019eau douce ou l\u2019eau de mer, dans notre corps, o\u00f9 ils font partie de la flore intestinale, sur les feuilles des plantes et \u00e0 l\u2019int\u00e9rieur de celles-ci. On en retrouve aussi  jusque dans le bois des ceps de vigne et des troncs d\u2019arbres.<\/p>\n\n\n\n

Katia Gindro, chercheuse \u00e0 l\u2019Agroscope, \u00e9tudie depuis de nombreuses ann\u00e9es cet univers encore tr\u00e8s m\u00e9connu et souvent n\u00e9glig\u00e9 des champignons microscopiques.<\/p>\n\n\n\n

Un des buts de ses recherches est de trouver de nouveaux traitements fongicides contre les principales maladies fongiques des plantes cultiv\u00e9es. Certains champignons cultivables en laboratoire produisent ainsi des substances anti-fongiques, anti-bact\u00e9riennes et d\u00e9ploient toutes sortes d\u2019autres activit\u00e9s biologiques. Il s\u2019agit aussi de mieux comprendre les maladies qui affectent nos cultures, comme la vigne, dont le mildiou, l\u2019o\u00efdium et la pourriture grise, qui sont toutes les trois des maladies fongiques, c\u2019est-\u00e0-dire caus\u00e9es par des champignons. Au final, il s\u2019agit de trouver de nouvelles pistes pour prot\u00e9ger les vignes, par exemple en identifiant des esp\u00e8ces capables d\u2019occuper le terrain \u00e0 la place des champignons nuisibles.

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Spores de mildiou observ\u00e9s en fluorescence au microscope \u00a9 Agroscope<\/p>\n\n\n\n

De nouvelles pistes pour prot\u00e9ger la vigne<\/strong><\/p>\n\n\n\n

D\u2019autres \u00e9tudes men\u00e9es dans les vignes ont montr\u00e9 qu\u2019il y a 150 \u00e0 200 esp\u00e8ces de champignons \u00e0 l\u2019int\u00e9rieur des ceps. L\u2019esca, par exemple, est une maladie qui fait brusquement d\u00e9p\u00e9rir certains ceps. Cette maladie a longtemps \u00e9t\u00e9 attribu\u00e9e \u00e0 des champignons microscopiques, capables de p\u00e9n\u00e9trer dans le cep, notamment par des plaies de taille. Mais le probl\u00e8me est plus complexe qu\u2019il n\u2019y para\u00eet : il semble r\u00e9sulter d\u2019un encha\u00eenement de troubles physiologiques chez la vigne, qui favorisent ensuite le d\u00e9veloppement de ces champignons, jusqu\u2019\u00e0 provoquer le dess\u00e8chement complet du cep.<\/p>\n\n\n\n

Les champignons capables de se nourrir du bois peuvent rester des ann\u00e9es sans causer de soucis \u00e0 la vigne. Jusqu\u2019au moment o\u00f9 la maladie se d\u00e9clare. Le dess\u00e8chement complet du cep peut alors survenir en quelques jours, de fa\u00e7on aussi soudaine que spectaculaire. Le d\u00e9clenchement de la maladie est assez myst\u00e9rieux car les ceps qui d\u00e9p\u00e9rissent ont la m\u00eame communaut\u00e9 d\u2019esp\u00e8ces fongiques \u00e0 l\u2019int\u00e9rieur de leur tronc que les ceps qui se portent bien.<\/p>\n\n\n\n

C\u2019est donc ailleurs qu\u2019il faut chercher l\u2019explication. \u00ab Ce qui d\u00e9clenche l\u2019esca est peut-\u00eatre d\u00fb \u00e0 un affaiblissement du cep pour cause de s\u00e9cheresse ou de taille trop rude, ou encore de vignes ayant trop de vigueur. La communaut\u00e9 de champignons pr\u00e9sents va alors en profiter de mani\u00e8re opportuniste \u00bb, explique Katia Gindro, responsable du groupe mycologie de la Station f\u00e9d\u00e9rale de recherche Agroscope \u00e0 Changins.   <\/p>\n\n\n\n

C\u2019est un ph\u00e9nom\u00e8ne similaire \u00e0 celui de la sceptic\u00e9mie chez l\u2019\u00eatre humain, une infection g\u00e9n\u00e9ralis\u00e9e qui peut \u00eatre mortelle. En temps normal, les staphylocoques que nous avons sur la peau ne posent pas de probl\u00e8me. Mais chez certaines personnes affaiblies, ces m\u00eames staphylocoques peuvent provoquer de graves infections. <\/p>\n\n\n\n

Des millions d\u2019esp\u00e8ces inconnues<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Mais revenons \u00e0 nos champignons. Si on conna\u00eet bien ceux visibles \u00e0 l\u2019\u0153il nu, il reste par contre beaucoup \u00e0 faire pour \u00e9tudier les esp\u00e8ces microscopiques. Pour l\u2019instant, 150’000 esp\u00e8ces sont connues et d\u00e9crites, mais on estime qu\u2019il en reste 10 millions \u00e0 d\u00e9couvrir. L\u2019\u00e9tude de ces champignons microscopiques est encore compliqu\u00e9e par le fait que de nombreuses esp\u00e8ces sont impossibles \u00e0 cultiver ou qu\u2019il reste difficile de dissocier des communaut\u00e9s complexes de champignons.  Autrement dit, il est parfois impossible d\u2019isoler une esp\u00e8ce en particulier pour l\u2019\u00e9tudier individuellement. \u00c0 commencer par certaines esp\u00e8ces de champignons qui font partie de notre flore intestinale. Enfin, les champignons sont tr\u00e8s compliqu\u00e9s \u00e0 \u00e9tudier au niveau fonctionnel. \u00ab Il est souvent difficile de dire quel est leur r\u00f4le \u00e9cologique pr\u00e9cis, d\u00e9fense de l\u2019h\u00f4te ou symbiose fonctionnelle. Mais de toute fa\u00e7on, ils sont une des composantes fondamentales de la biodiversit\u00e9 d\u2019un \u00e9cosyst\u00e8me\u00bb, explique Katia Gindro.

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\"\"<\/figure>\n\n\n\n

Diverses esp\u00e8ces de champignons microscopiques, pr\u00e9lev\u00e9es dans l\u2019air ambiant puis mises en culture \u00a9 Agroscope<\/p>\n\n\n\n

Une biodiversit\u00e9 invisible<\/strong><\/p>\n\n\n\n

C\u2019est pour cette raison que le projet \u00ab Life on trees \u00bb, recense non seulement les mousses ou les orchid\u00e9es, mais aussi les champignons que l\u2019on trouve dans les arbres, des racines aux feuilles en passant par l\u2019\u00e9corce. On trouve ainsi des centaines esp\u00e8ces diff\u00e9rentes dans les troncs d\u2019arbres et l\u2019\u00e9tude de deux immenses arbres, l\u2019un au P\u00e9rou et l\u2019autre en Colombie, ont montr\u00e9 qu\u2019ils forment un \u00e9cosyst\u00e8me en soi. Les champignons qui vivent dans le bois d\u00e9fendent en effet chacun leur territoire, ce qui est vrai dans n’importe quel arbre. <\/p>\n\n\n\n

Chaque insecte a aussi sa communaut\u00e9 sp\u00e9cifique de myco-organismes. Il y a ainsi des champignons sp\u00e9cialis\u00e9s qui vivent dans les insectes et d\u2019autres qui vont les envahir et les consommer. \u00ab Quand on sauve un insecte, on sauve aussi toute une biodiversit\u00e9 cach\u00e9e \u00bb r\u00e9sume Katia Gindro. Autrement dit, pour sauvegarder la biodiversit\u00e9 en g\u00e9n\u00e9ral, il faut prendre en compte tous les organismes. Y compris ceux qui sont invisibles \u00e0 l\u2019\u0153il nu et que l\u2019on oublie souvent pour cette raison.<\/p>\n\n\n\n

A Montricher, dans le Jura vaudois, les bois ont \u00e9t\u00e9 mis en r\u00e9serve naturelle en 2003 et les champignons microscopiques ont \u00e9t\u00e9 inclus dans les travaux de recherche sur la biodiversit\u00e9. \u00ab C\u2019\u00e9tait tr\u00e8s int\u00e9ressant \u00bb, rel\u00e8ve Katia Gindro.<\/p>\n\n\n\n

H\u00e9l\u00e8ne Koch<\/p>\n\n\n\n

La Soci\u00e9t\u00e9 vaudoise des Sciences Naturelles organise une fois par mois une conf\u00e9rence tout public sur un sujet scientifique. Voici un retour sur celle donn\u00e9e par Katia Gindro, responsable du groupe mycologie de la Station f\u00e9d\u00e9rale de recherche Agroscope.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

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