{"id":10986,"date":"2024-01-09T16:46:48","date_gmt":"2024-01-09T15:46:48","guid":{"rendered":"https:\/\/wp.unil.ch\/geoblog\/?p=10986"},"modified":"2024-04-23T08:52:56","modified_gmt":"2024-04-23T06:52:56","slug":"ils-decodent-les-methodes-de-colonisation-a-travers-la-communication-des-bacteries-e-coli","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/wp.unil.ch\/geoblog\/2024\/01\/ils-decodent-les-methodes-de-colonisation-a-travers-la-communication-des-bacteries-e-coli\/","title":{"rendered":"Ils d\u00e9codent les m\u00e9thodes de colonisation \u00e0 travers la communication des bact\u00e9ries E. coli"},"content":{"rendered":"\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><a href=\"https:\/\/wp.unil.ch\/geoblog\/files\/2024\/01\/mouse_gut.jpg\"><img alt=\"\" loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"1024\" height=\"768\" src=\"https:\/\/wp.unil.ch\/geoblog\/files\/2024\/01\/mouse_gut-1024x768.jpg\" alt=\"\" class=\"wp-image-10989\" srcset=\"https:\/\/wp.unil.ch\/geoblog\/files\/2024\/01\/mouse_gut-1024x768.jpg 1024w, https:\/\/wp.unil.ch\/geoblog\/files\/2024\/01\/mouse_gut-300x225.jpg 300w, https:\/\/wp.unil.ch\/geoblog\/files\/2024\/01\/mouse_gut-768x576.jpg 768w, https:\/\/wp.unil.ch\/geoblog\/files\/2024\/01\/mouse_gut-1536x1152.jpg 1536w, https:\/\/wp.unil.ch\/geoblog\/files\/2024\/01\/mouse_gut-1320x990.jpg 1320w, https:\/\/wp.unil.ch\/geoblog\/files\/2024\/01\/mouse_gut.jpg 1600w\" sizes=\"auto, (max-width: 1024px) 100vw, 1024px\" \/><\/a><figcaption class=\"wp-element-caption\">Les chercheurs ont reproduit, sur une puce en silicone, une structure en forme d&rsquo;intestin.&nbsp;Ici, un v\u00e9ritable intestin de souris, image cr\u00e9dit: HistoPathology Core Facility, Institut Pasteur.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-group has-background has-global-padding is-layout-constrained wp-block-group-is-layout-constrained\" style=\"background-color:#eeeeee\">\n<div class=\"wp-block-image is-style-rounded\"><figure class=\"alignleft size-full is-resized\"><a href=\"https:\/\/wp.unil.ch\/geoblog\/files\/2021\/09\/deanna.jpg\"><img alt=\"\" loading=\"lazy\" decoding=\"async\" src=\"https:\/\/wp.unil.ch\/geoblog\/files\/2021\/09\/deanna.jpg\" alt=\"\" class=\"wp-image-6983\" width=\"250\" height=\"250\" \/><\/a><figcaption>Pietro de Anna, Institut des sciences de la Terre<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n<p><strong>Naturellement pr\u00e9sentes dans notre tube digestif, les bact\u00e9ries E. coli ont des fa\u00e7ons bien sp\u00e9cifiques de communiquer et de coloniser les milieux complexes. A l\u2019UNIL, des scientifiques ont reproduit la structure complexe d\u2019un intestin sur une puce, et d\u00e9cortiqu\u00e9 ces m\u00e9canismes pour la premi\u00e8re fois. L\u2019\u00e9tude est parue dans&nbsp;<em>Nature communications<\/em>, et elle constitue une \u00e9tape vers une meilleure compr\u00e9hension des interactions entre h\u00f4te et microbes.<\/strong><\/p>\n\n\n\n<div style=\"height:1px\" aria-hidden=\"true\" class=\"wp-block-spacer\"><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n<p>En moyenne, un intestin humain comprend pr\u00e8s de 2 kilos de bact\u00e9ries, soit pr\u00e8s de 10&rsquo;000 milliards d\u2019individus, appartenant \u00e0 1000 esp\u00e8ces diff\u00e9rentes. Pami elles se trouvent les bact\u00e9ries&nbsp;Escherichia coli, habituellement inoffensives et b\u00e9n\u00e9fiques, mais dont certaines souches minoritaires sont pathog\u00e8nes. On ne comprend toutefois pas vraiment les m\u00e9canismes qui r\u00e9gissent leur comportement. Comment communiquent-elles entre elles&nbsp;?&nbsp;&nbsp;De quelle fa\u00e7on colonisent-elles des environnements \u00e0 la structure complexe, tel que le tube digestif humain&nbsp;?&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>A l\u2019UNIL, une \u00e9quipe de la Facult\u00e9 des g\u00e9osciences et de l\u2019environnement (FGSE), en collaboration avec une \u00e9quipe de la Facult\u00e9 de Biologie et M\u00e9decine (FBM) a d\u00e9cortiqu\u00e9 les processus de colonisation d\u2019un milieu sinueux par ces bact\u00e9ries. Deux m\u00e9canismes ont \u00e9t\u00e9 \u00e9tudi\u00e9s\u00a0: leurs d\u00e9placements provoqu\u00e9s par des stimuli chimiques (chimiotaxie), et leur facult\u00e9 d\u2019estimer le nombre de leurs semblables alentours (d\u00e9tection quorum), et de r\u00e9agir en cas de surnombre. La recherche a \u00e9t\u00e9 publi\u00e9e dans\u00a0<em>Nature Communication<\/em>. Elle ouvre la porte \u00e0 une meilleure compr\u00e9hension du rapport entre microbes et personne h\u00f4te, ainsi que des cons\u00e9quences sur la sant\u00e9 de ce dernier.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-embed is-type-video is-provider-youtube wp-block-embed-youtube wp-embed-aspect-16-9 wp-has-aspect-ratio\"><div class=\"wp-block-embed__wrapper\">\n<iframe loading=\"lazy\" title=\"Wild Wild Gut\" width=\"500\" height=\"281\" src=\"https:\/\/www.youtube.com\/embed\/Easil48uswc?feature=oembed\" frameborder=\"0\" allow=\"accelerometer; autoplay; clipboard-write; encrypted-media; gyroscope; picture-in-picture; web-share\" referrerpolicy=\"strict-origin-when-cross-origin\" allowfullscreen><\/iframe>\n<\/div><\/figure>\n\n\n\n<h5 class=\"wp-block-heading\">Un intestin sur puce<\/h5>\n\n\n\n<p>Pour mener \u00e0 bien leur recherche, les scientifiques ont reproduit la structure d\u2019un intestin sur une puce microfluidique, dans laquelle ils ont inject\u00e9 des nutriments (du glucose), ainsi que des bact\u00e9ries E. coli. Dans ce milieu \u00e9triqu\u00e9, les bact\u00e9ries se diffusent, puis elles s\u2019accumulent dans les cavit\u00e9s, pour prendre part \u00e0 un petit festin.&nbsp;Elles consomment de l\u2019oxyg\u00e8ne et absorbent le glucose \u00e0 disposition, rel\u00e2chant des substances produites par leur activit\u00e9 m\u00e9tabolique (comme l\u2019AI-2). \u00ab&nbsp;Ce signal agit comme un stimulus chimique, qui attire les autres bact\u00e9ries nageant \u00e0 proximit\u00e9. Ainsi, la cavit\u00e9 se remplit de plus en plus, jusqu\u2019\u00e0 en devenir bond\u00e9e&nbsp;\u00bb, explique Pietro De Anna, professeur \u00e0 la FGSE et co-auteur de l\u2019\u00e9tude.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>Un deuxi\u00e8me ph\u00e9nom\u00e8ne se produit alors. Lorsque tous les nutriments sont consomm\u00e9s, les bact\u00e9ries vont activer une sorte de d\u00e9tecteur leur permettant d\u2019estimer la densit\u00e9 de la foule autours d\u2019elles. \u00ab&nbsp;En estimant la quantit\u00e9 des signaux, les bact\u00e9ries remarquent soudain que l\u2019endroit, qui est une impasse, est plein \u00e0 craquer&nbsp;: leur survie est en jeu&nbsp;\u00bb, pr\u00e9cise le&nbsp;professeur. Les bact\u00e9ries produisent d\u00e8s lors de la biomasse plus rapidement que d\u2019habitude. Elles se multiplient le plus possible, afin de cro\u00eetre suffisamment pour sortir de la cavit\u00e9.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p>\u00ab Il est essentiel de comprendre comment les bact\u00e9ries colonisent des environnements complexes et h\u00e9t\u00e9rog\u00e8nes, tels que l&rsquo;intestin, pour comprendre le fonctionnement des ph\u00e9nom\u00e8nes naturels, et ceux qui m\u00e8nent \u00e0 une pathologie \u00bb, commente Pietro De Anna. \u00ab&nbsp;Par ailleurs, comme l\u2019AI-2 est un mode de communication inter-esp\u00e8ce, notre recherche pourrait donner des indications pr\u00e9cieuses pour d\u2019autres esp\u00e8ces de bact\u00e9ries.&nbsp;\u00bb<\/p>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-columns is-layout-flex wp-container-core-columns-is-layout-28f84493 wp-block-columns-is-layout-flex\">\n<div class=\"wp-block-column has-background is-layout-flow wp-block-column-is-layout-flow\" style=\"background-color:#eeeeee;flex-basis:60%\">\n<div class=\"wp-block-group has-background has-global-padding is-layout-constrained wp-block-group-is-layout-constrained\" style=\"background-color:#eeeeee\">\n<h5 class=\"wp-block-heading\">Source<\/h5>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>D. Scheidweiler, A.D. Bordoloi, W. Jiao, V. Sentchilo, M. Bollani, A. Chhun, P. Engel &amp; P. de Anna,&nbsp;<a href=\"https:\/\/www.nature.com\/articles\/s41467-023-44267-y\">Spatial structure, chemotaxis and quorum sensing shape bacterial biomass accumulation in complex porous media<\/a>, <em><strong>Nature Communications<\/strong><\/em>, 2024<\/li>\n<\/ul>\n<\/div>\n<\/div>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-column is-layout-flow wp-block-column-is-layout-flow\"><\/div>\n<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Naturellement pr\u00e9sentes dans notre tube digestif, les bact\u00e9ries E. coli ont des fa\u00e7ons bien sp\u00e9cifiques de communiquer et de coloniser les milieux complexes. A l\u2019UNIL, des scientifiques ont reproduit la structure complexe d\u2019un intestin sur une puce, et d\u00e9cortiqu\u00e9 ces m\u00e9canismes pour la premi\u00e8re fois. 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